近日,华点云受邀参加上海分子病理新技术进展与应用高峰论坛,就CelBox(基因解读智能盒子,以下简称“CelBox”)在临床分子病理中的应用做了精彩演讲,并在会上透露将携手阿里云共建分子病理云平台,解决病理“最后一公里”。
1
随着分子诊断技术的发展,也将病理学带入分子病理学时代,对疾病的病因、发生、发展、发病机制以及形态变化,已从传统的形态学诊断深入到蛋白质和核酸水平。可以获得疾病的易感性、鉴别诊断、预后分析、个性化治疗以及预测、感染检测、遗传性疾病的诊断和个体识别等具有诊断与指导性的内容。
病理诊断是疾病诊断的重要依据,约70% 的临床诊断需要依赖于病理诊断结果。病理医生也被神圣的称之为“医生的医生”。但由于我国医院数量大,医疗水平参差不齐,加之病理医生又非常的稀缺(有研究统计,我国病理医生的缺口总数估计在10万人左右),为病理学新技术的发展形成制约。
要解决这一资源缺口,一方面是要重视病理医生的培养,另一方面,“互联网+”数字化病理分析技术为解决这一难题带来机遇。
华点云牵手阿里云、上海誉源生物,共同构建分子病理云平台(以下简称“病理云”),帮助病理医生快速分析并交付检测报告。
阿里云在云计算、大数据领域有着丰富的经验和积累。与其合作,可以有效的解决病理云在数据传输、处理、安全保护、高并发等方面严苛的要求。
病理云将前沿的生信技术、大数据技术、云计算技术相结合,把数据分析到报告出具的繁琐过程程序化、流程化、自动化,一键上传数据到病理云,可自动化运行分析,几分钟甚至几秒钟就可以出具检测报告,并自动化的交付到医院的病理系统中。无需专业的分析与报告解决人员,即可轻松的搞定病理报告,为广大的病理医生提供全新、灵活、便捷的报告交付体验。
同时,病理云将部署华点云现已经开发完成并经临床验证的生信分析流程、数据库、IT算法,并根据临床需求、病理科需求,不断的迭代并完善病理云中的应用,最大化的为病理医生提供便捷。
现在,分子病理云已经上线(网址:pathology.celloud.cn),华点云诚挚邀请病理医生进行内测,共同推进分子病理的健康发展。
2
华点云自主研发的另一产品CelBox基因解读智能盒子,作为数据处理本地化产品,也可以帮助医院实现从测序数据到分析、解读、报告交付一体化的解决方案。
CelBox是集计算机软、硬件为一体。部署的生信算法参考国际权威算法,生信流程经过多专家审核、软件评估、多年临床验证,并加入经过整理的国际权威数据库与中国人特有数据库,以保证数据解读的准确性;同时,硬件与着名厂商合作进行设计优化、实验验证,以满足不同检测项目的需求,确保数据计算的高效性与存储的稳定性。
CelBox有着健全的安全控制体系,如硬件物理安全、网络安全、应用安全等。
CelBox可以帮助医院对接众多基因检测项目、分析流程以及数据格式。包括:
检测项目:肿瘤个体化治疗和用药检测、病原菌感染检测、遗传代谢病检测、慢病检测;
检测分析方法:16S/18S/ITS、WGS、转录mRNA、全外显子、宏基因组、目标区域;
检测平台:基因芯片、PCR技术、FISH技术、Sanger测序技术、NGS;
数据格式:SAM、BAM、TXT、XLS、FASTA、FASTQ、ABI、VCF。
CelBox已经获得了多项专利与软着。如鉴定细菌的多重PCR引物对组合及鉴定方法、高通量测序数据统计方法和统计装置、样本管理系统、分析流程管理系统、项目网络系统等等,
以及中国质量认证中心颁发的3C认证证书。
3
华点云以解决用户的实际需求为出发,搭建准确、有价值且可直接应用于临床的准确医疗产品及服务体系,并提供整体化的解决方案。华点云也希望通过分子病理云,推进分子病理的快速发展,为医疗事业做贡献。